Interesującym elementem wystroju jest pięć współczesnych witraży, wykonanych w latach 1981-1982 według projektu Teresy Reklewskiej. W oknie znajdującym się w południowej ścianie transeptu, nad rzeźbą Chrystusa Frasobliwego, umieszczono witrażowe przedstawienie Chrystusa w chwale i Czterech Jeźdźców Apokalipsy – inspirowane treścią Apokalipsy św. Jana (Ap 6, 1-8). Z kolei w oknach bocznych, we wschodniej i zachodniej ścianie południowego ramienia transeptu, znajdują się witraże z abstrakcyjnymi kompozycjami niefiguralnymi. 

Warto zauważyć, że maswerki w oknach transeptu pochodzą z XIX i XX wieku. Wyjątkiem jest maswerk w oknach we wschodniej i zachodniej ścianach południowego ramienia transeptu, który odpowiada przeźroczu zamurowanego otworu okiennego – znajdującego się ponad wejściem do kaplicy chrzcielnej w dolnej kondygnacji wieży kościoła. Można przypuszczać, że dwudzielne okna transeptu były wypełnione prostym maswerkiem z pierścieniem w jego górnej części, zachowanym we wspomnianych miejscach. Prawdopodobnie oryginalne maswerki wykonano w latach 60. XIII wieku.